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目的：评估对比配对的胃腺癌活检标本及外科病理手术标本临床病理学特征及HER2表达，研究其异质性并评估临床意义。方法：选取2011年1月-2013年1月本院诊断的胃食管交界区普通型腺癌内镜活检标本及相应的肿瘤手术切除标本患者98例，并收集相应的临床病理学资料，用免疫组化（IHC）及原位荧光杂交（FISH）法检测内镜活检标本及相应的肿瘤手术切除标本HER2蛋白过表达和基因扩增情况，观察并分析其异质性表达的情况，分析临床病理学特征，评估临床意义。结果：98例胃腺癌患者中免疫组化HER2阳性16例（16．3％），