辣椒疫霉NPP效应子基因家族生物信息学分析

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NPP(necrosis—inducingPhytophthoraprotein)是一类效应子,在卵菌疫霉属病原菌中普遍存在,该类蛋白能够激发植物的防御反应,如引起植物细胞死亡、促使寄主防御基因表达及产生乙烯。利用生物信息学方法对辣椒疫霉(Phytophthoracapswi)基因组内的NPP基因家族存在状况进行分析,并对其氨基酸序列组成、基本理化性质、蛋白质三级结构等进行预测分析,旨在了解其结构特征,进而发掘辣椒疫霉的致病相关基因。结果表明:NPP基因家族有25个成员,其中大部分成员存在多个拷贝。对25
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