【摘 要】
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采用第二代Illumina HiSeq测序技术对闽楠的木质部、韧皮部、叶片进行转录组测序,分别获得Clean Reads片段41383707条、43343922条、44191586条,经转录本拼接后得到序列总长
【基金项目】
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福建省林业厅林木种苗科技攻关五期项目(闽林[2016]9号),福建省科技厅引导性项目(2016N0001)
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采用第二代Illumina HiSeq测序技术对闽楠的木质部、韧皮部、叶片进行转录组测序,分别获得Clean Reads片段41383707条、43343922条、44191586条,经转录本拼接后得到序列总长度达120535288 bp的383331条Conting片段,进一步组装得到平均长度为542 bp的151729条Unigenes。将闽楠转录组Unigenes进行基因功能注释,与NR数据库比对发现,其与葡萄的相似序列最多(34%),与黄瓜、野草莓、大豆的同源性较低(各占3%);进行GO功能注释,
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