人肝细胞癌中HNF4α近端启动子区生物信息学分析

来源 :安徽医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lm403379799

【摘要】

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目的应用生物信息学数据库挖掘数据,预测分析肝细胞癌发生发展过程中抑癌基因肝核转录因子4α(HNF4α)表达下调的转录调控机制。方法从美国国家生物技术信息中心在线核苷酸数

【作者】

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曹辉许钟陈燕平张玲玲鲁亮

【机构】

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贵州省人民医院肿瘤科,贵州省人民医院消化内科

【出处】

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安徽医科大学学报

【发表日期】

：

2020年1期

【关键词】

：

HNF4α 启动子转录因子生物信息学肝细胞癌 HNF4αpromotertranscription factorbioinformaticsHCC

【基金项目】

：

国家自然科学基金(编号:81860439),贵州省科学技术基金(编号:黔科合J字[2012]2241号).

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目的应用生物信息学数据库挖掘数据,预测分析肝细胞癌发生发展过程中抑癌基因肝核转录因子4α(HNF4α)表达下调的转录调控机制。方法从美国国家生物技术信息中心在线核苷酸数据库获得HNF4α基因的启动子序列;应用Promotor Scan、Patch、P-Match、Ali Baba2等在线转录因子预测软件分析HNF4α转录因子结合位点;应用在线肝脏基因数据库liveratlas筛查肝癌组织中表达下调的基因,与预测的转录因子进行对比。通过TCGA数据库提取相关转录因子与HNF4α的肝癌组织芯片表达结果,进行相

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