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自上世纪90年代以来，上海师范大学第二附属中学一直保持着“上海市花园单位”的称号，致力于把校园建设成为生态保育和生物多样性保护基地。校园内植物种类繁多，拥有乔木、灌木、地被植物达145种，还有裸子植物门的五大纲植物、上海仅有的七种国家保护植物（榉树、香樟、普陀樟、舟山新木姜子、野大豆、水蕨和明党参）等。