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结肠储袋能改善低位直肠切除保肛术后早期控制排粪功能障碍，但其对患者术后远期（2年以上）控制排粪功能方面不具有优势。同时，随着时间的延长，排空障碍的发生率将逐渐提高，很多患者出现排粪困难，需要长期应用栓剂和灌肠。而储袋的制作延长了手术时间，增加了治疗费用。所以，低位直肠切除术后结肠储袋的价值正在遭受质疑，它的应用也变得越来越少。在溃疡性结肠炎（UC）和家族性腺瘤性息肉病（FAP）行全结肠切除术后，如果行回肠储袋肛管吻合（IPAA），可通过增加新建直肠的容积并改变肠管的生理学动力，使排粪次数减少；且术后短期和长期控制排粪功能更好，生活质量更高。所以，IPAA是手术治疗UC和FAP的首选。