拟南芥4-香豆酰-CoA连接酶基因的克隆与生物信息学分析

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以拟南芥总RNA为模板,利用RT-PCR的方法从拟南芥中扩增获得一条4-香豆酰-CoA连接酶基因完整的cDNA序列,命名为4CL1。利用生物信息学生物软件对其核酸和蛋白质序列进行分析,结果表明,该序列长1 686bp,与已报道的拟南芥4-香豆酰-CoA连接酶基因的序列相似性达到98%~100%,氨基酸序列相似性为99%~100%;4CL1基因编码561个氨基酸,该氨基酸序列具有典型的4-香豆酰-CoA连接酶AMP-binding保守结构域LPYSSGTTGLPK,同时含有该蛋白家族的催化活性中心GEICI
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