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目的 探讨并鉴定乳头状甲状腺癌患者血清中肿瘤相关蛋白作为特异性标志物的可能性。方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测35例乳头状甲状腺癌、40例甲状腺良性结节和34例健康对照者的血清标本，应用生物信息学方法筛选差异蛋白峰，经高效液相色谱（HPLC）分离出差异蛋白，酶解后进行液质联用串联质谱（LC-MS/MS）分析，用SEQUEST检索程序查询Bioworks数据库蛋白序列进行鉴定。结果 筛选出6个最显著的差异蛋白质，质荷比（M/Z）分别位于6651、6452、7653、7932、15106和15848。M/Z位于6651、6452处的蛋白质在乳头状甲状腺癌组表达低于甲状腺良性结节和健康对照组；M/Z位于7653、7932、15106、15848处的蛋白质在乳头状甲状腺癌组表达高于甲状腺良性结节和健康对照组，差异均有统计学意义（均P〈0.01）。联合6种潜在蛋白质标志物，区别乳头状甲状腺癌和非乳头状甲状腺癌的特异度为88.0%，敏感度为92.5%。M/Z位于6651、6452、7653和15106、7932和15848处的蛋白标志物分别为载脂蛋白C-Ⅰ、载脂蛋白C-Ⅲ、α-珠蛋白、β-珠蛋白。结论 鉴定出的载脂蛋白C-Ⅰ、载脂蛋白C-Ⅲ、α-珠蛋白和β-珠蛋白在乳头状甲状腺癌的诊断中具有一定的价值和广泛的应用前景，值得进一步研究和探讨。