编码日本梨树(Pyrus pyrifolia)花粉类β-1,3-葡聚糖酶蛋白的cDNA克隆与核苷酸序列

来源 :农业生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangcongyu003
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构建了日本梨树(Pyrus pyrifolia)花粉cDNA文库,发现了一个编码花粉管分泌的类β-1,3-葡聚糖酶蛋白(BGN-1)的cDNA(bgn-1)并测定了其序列.bgn-1由1408 bp组成,包括47 bp的5-非翻译区,由1194bp组成并编码了397个氨基酸的ORF和167 bp的3-非翻译区.3-非翻译区含有1个NUE(AATTAA)和3个似FUE的基序,分别位于1369~1374(AATTAA)、1320~1325、1327~1332(TTTTTA)和1363~1368(TTTGGA).bgn-1编码的蛋白(BGN-1)与DDBJ中的植物β-1,3-葡聚糖酶的序列相似性范围为37%~59%,与3D结构已知的大麦β-1,3-葡聚糖酶(GⅡ)的序列相似性为39.7%.对GⅡ与BGN-1进行的疏水簇分析(HCA同源分为87.1%,>75%的一般标准)和使用3D-PSSM软件进行的分析暗示,BGN-1的3D结构与大麦GⅡ同源性最大(≥95%的肯定度).BGN-1的信号肽长度为22 aa,成熟的BGN-1(375 aa)的理论分子量为4 0723 D,理论pI值为9.59,诊断氨基酸残基模式(D,L,S,L)与禾谷类的与生长相关的亚家族D的诊断氨基酸残基模式(D,L,S,Q)极相似.在BGN-1的C-端延伸区的位点352~367之间发现了1个功能不清,重复出现的ProXXPro结构.
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