【摘 要】
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目的 构建肾透明细胞癌预后分子标签及列线图.方法 提取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中相关数据,利用R语言及其相关算法包对数据进行差异表达分析、Lasso-Cox回归分析构建肾透明细胞癌预后分子标签,并联合临床数据构建肾透明细胞癌预后列线图.结果 筛选出530例肾透明细胞癌患者肿瘤及正常肾组织中差异表达的RNA 5759种,进一步采用Lasso-Cox回归分析从中筛选出9种肾透明细胞癌预后相关RNA,分别为DYNLL1P4、LINC01956、PLG、SNORA70B、ZIC2、AC011700.1、A
【机 构】
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236000 安徽省阜阳市人民医院泌尿外科
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目的 构建肾透明细胞癌预后分子标签及列线图.方法 提取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中相关数据,利用R语言及其相关算法包对数据进行差异表达分析、Lasso-Cox回归分析构建肾透明细胞癌预后分子标签,并联合临床数据构建肾透明细胞癌预后列线图.结果 筛选出530例肾透明细胞癌患者肿瘤及正常肾组织中差异表达的RNA 5759种,进一步采用Lasso-Cox回归分析从中筛选出9种肾透明细胞癌预后相关RNA,分别为DYNLL1P4、LINC01956、PLG、SNORA70B、ZIC2、AC011700.1、AC091812.1、AC104958.1、AL133255.1,并构建了肾透明细胞癌预后分子标签:0.2555×EXPDYNLL1P4+0.1442×EXPLINC01956-0.0695×EXPPLG+0.2534×EXPSNORA70B+0.0842×EXPZIC2+0.2342×EXPAC011700.1+0.1036×EXPAC091812.1+0.2575×EXPAC104958.1+0.1326×EXPAL133255.1.结论 通过对TCGA数据库的挖掘,发现对肾透明细胞癌预后有影响的9种基因,且联合9种RNA构建的分子标签与肾透明细胞癌患者的预后有显著性关联,构建的肾透明细胞癌预后模型有望应用于临床.
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