NaCl胁迫下柳树的转录组测序与初步分析

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从组学水平分析盐胁迫下柳树内在分子机制,为柳树耐盐研究及耐盐基因的挖掘利用提供理论依据。本研究通过转录组测序技术对‘盐柳1号’(Salix psammophila ’Yanliu No.1’)和‘渤海柳1号’(Salix matsudana ’Bohailiu No.1’)经150 mmol/L NaCl胁迫处理后的叶片和正常叶片(对照)进行高通量转录组测序,并对获得的unigene进行从头组装和注释分析。结果表明:转录组测序共获得183 987条Unigenes,平均长度为1 080.18 bp,分别有120 130条、140 813条、98 066条、88 425条、47 982条、83 732条Unigenes被注释到NR、NT、SwissProt、KEGG、COG和GO数据库,共有149 864条(81.45%) Unigenes得到注释。在GO功能注释中,共得到55个GO功能小类,在KEGG代谢通路分析时,获得了135条KEGG通路。该转录组测序数据质量高,结果覆盖面广,为柳树耐盐基因挖掘和研究提供了一定的理论参考。
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