基于RNA-seq技术的青藏高原不同海拔水毛茛转录组测序及基因表达分析

来源 :植物科学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：BING_YAN3414

【摘要】

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以青藏高原不同海拔7个居群的水毛茛(Batrachium bungei(Steud.)L.Liou)为材料,对其进行转录组测序及基因表达分析,研究它们在极端环境下基因表达方面的适应性。结果显示,7个

【作者】

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陈飞飞姬亚丽陈忠海刘泰龙刘星

【机构】

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西藏大学理学院,西藏大学青藏高原生态与环境研究中心极端环境生物适应与进化实验室,武汉大学生命科学学院

【出处】

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植物科学学报

【发表日期】

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2021年1期

【关键词】

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水毛茛转录组测序差异表达富集分析类黄酮 Batrachium bungei Transcriptome sequencing Differential

【基金项目】

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国家自然科学基金项目(31860046)

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以青藏高原不同海拔7个居群的水毛茛(Batrachium bungei(Steud.)L.Liou)为材料,对其进行转录组测序及基因表达分析,研究它们在极端环境下基因表达方面的适应性。结果显示,7个居群内样本间的基因表达具有较高的相似性。差异基因富集分析结果发现苯丙烷生物合成相关基因在5个差异组中均呈显著富集;此外类黄酮、类胡萝卜素、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸的生物合成以及激素的信号转导、MAPK信号通路、植物与病原菌互作等相关基因大多被显著富集。与低海拔居群相比,参与类黄酮生物合成通路的相关基因(HHT1

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