基于加权基因共表达网络分析探究桑树光合相关基因的调控模式

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基于前期桑树转录组数据和光合表型数据,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)共获得10个基因模块与表型关联,筛选到MEmagenta、MEgreen、MEyellow、MEpurple和MEblack光合相关基因模块。GO和KEGG分析显示,DEGs显著富集在光合相关酶活性、碳代谢和固碳等途径,筛选到12个与光合作用高度相关的基因。通过RNA-seq结合WGCNA分析,筛选了3个光合关键基因,即光系统Q(B)蛋白L484_000029基因、核糖二磷酸羧化酶L484_000836基因、核糖二磷酸羧化酶/加氧酶激活酶2 L484_025354基因。该结果为进一步研究桑树光合作用调控机理提供支持。
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