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地方高校通过合并，优化配置各种教育资源，使其更加有效地合理利用，相互取长补短，产生“1＋1〉2”的合并效果。其中，学科资源优化在教育资源优化配置系统中占有十分重要的位置。但由于合并后学科资源的多样性和复杂性，不可避免地存在一些问题。通过对存在问题的原因分析，提出在优化配置学科资源的过程中应遵循整体性原则、增效性原则以及发展性原则，更新理念，优化学科结构，重视学科资源间的联系，使学科交叉、融合，形成一个优化、动态发展的学科资源系统。