钦差大臣的特殊政治身份和地位容易滋生腐败、渎职等犯罪行为,为了加强对这类特殊职官队伍的管理,维护皇权的权威,实现政治清明,清代中央针对钦差大臣制定了一系列的管理措施。主要包括对钦差大臣随从人员的数量、职权、行为等作了明确规定,明令禁止钦差及其随从索贿或过度干预地方事务;对钦差大臣出行的交通工具、驿站的接待规格与服务内容等也有详细规定,简化钦差出行的排场,减少铺张浪费;钦差与地方官共同处理问题,需要联名向皇帝奏报,朝廷对钦差与地方官的署名排序问题同样有细致的要求,以规范朝廷文书,避免官员之间的矛盾;根据钦差担负任务的差异,对钦差外出的关防印信是否需要颁给、何时颁给、何人掌管、如何使用等也有严格要求;钦差巡视军营要按照皇帝巡营的仪式进行,以加强皇权对军队的影响;钦差被派往地方还有职责收集所见所闻,特别是留心地方吏治,及时发现影响朝廷统治的各种不安定因素,及时反馈给朝廷,帮助朝廷掌握官员品行、民风民俗等。这些措施是清朝统治者为巩固统治地位,加强廉政制度建设的努力和尝试,一定程度上起到了规范官员行为、杜绝贪污腐败的作用,对现实社会具有借鉴意义。