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科学基金制在我国的实施虽不足20年，但它的出现打破了原来科研经费条块分割的分配方式，引入了竞争机制，促进了创新思想的产生，对我国科技进步尤其是基础及应用基础研究的发展起到了巨大的推动作用。目前，国家自然科学基金已经成为我国支持基础科学及应用基础科学研究的重要渠道之一，同时科学基金制本身也不断完善，得到了广泛的认可。