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棉花生物学国家重点实验室于2011年10月由科技部正式批准建设,依托中国农业科学院棉花研究所和河南大学联合共建。于2014年1月顺利通过了科技部组织的建设期验收,2017年6月通过科技部第一轮五年评估,评估结果为"良好"。实验室以学科发展前沿和国家重大战略需求为导向,围绕棉花生物学重大科学问题开展创新性、系统性的基础和应用基础研究,为棉花基础创新提供源动力、为棉花重大前沿问题的解决提供支撑、为棉花高层科研人才培养和交流提供平台。