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应用果胶酶对棉杆中的果胶类物质酶解处理后，可显著降低其生物饲料原料中的果胶含量，从而为后续的发酵工艺提供一定的营养成分。试验表明，对棉杆中果胶降解效果的影响因素中，降解温度影响最大，果胶酶添加量次之；酶解最佳工艺条件为：果胶酶添加量为0．6％，降解温度为45℃，保温时间为6 h。使用经过酶处理的棉杆原料进行发酵，所得饲料菌落总数增长到原来的2倍；p H 值为6．01，与未加酶原料的6．84相比下降了12％。