【摘 要】
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研究探讨依据基因组结构对根瘤菌进行系统发育分类的可行性.采用I-CeuI酶切及脉冲场电泳分析确定25株根瘤菌模式菌株的基因组结构,据此对根瘤菌进行聚群,并与16S rRNA聚群结
【机 构】
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北京大学基础医学院微生物学系,中国农业大学生物学院微生物系,北京大学基础医学院微生物学系,加拿大卡尔加里大学生化与分子生物学系
【基金项目】
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面向21世纪教育振兴行动计划(985计划)，MRC，NSERC
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研究探讨依据基因组结构对根瘤菌进行系统发育分类的可行性.采用I-CeuI酶切及脉冲场电泳分析确定25株根瘤菌模式菌株的基因组结构,据此对根瘤菌进行聚群,并与16S rRNA聚群结果相比较.依据基因组结构的近似或不同,25株根瘤菌共分为11个基因组型(genome type, GT).这些基因组型与依据16S rRNA序列的聚群结果大体一致,其不同之处显示了两种方法各自的特点.因此,基因组的物理结构,即本研究中rrn操纵子的数量及其在基因组上的位置,可作为系统发育关系的标志而用于根瘤菌的分类.
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