【摘 要】
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基因的聚类分析是基因表达数据分析研究的重要技术,它按照表达谱相近原则将基因表达数据归类,探究未知的基因功能.近年来,RNA-seq 技术广泛应用于测量基因表达水平,产生了大
【机 构】
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南京航空航天大学计算机科学与技术学院,南京林业大学信息科学技术学院
【基金项目】
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国家自然科学基金(61170152);航空基金(20151452021)~~
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基因的聚类分析是基因表达数据分析研究的重要技术,它按照表达谱相近原则将基因表达数据归类,探究未知的基因功能.近年来,RNA-seq 技术广泛应用于测量基因表达水平,产生了大量的读段数据,为基因表达聚类分析提供了充分条件.由于读段非均匀分布的特性,对读段计数一般采用负二项分布进行建模.现有的负二项分布算法和传统的聚类算法对于聚类分析都是直接对读段计数进行建模,没有充分考虑实验本身存在的各种噪声,以及基因表达水平测量的不确定性,或者对聚类中心的不确定性考虑不够.基于 PGSeq 模型,模拟读段的随机产生过程,
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