我国首例输入性裂谷热病例病毒全基因组测序分析

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目的

对我国首例输入性裂谷热病例病毒进行全基因组测定,分析其进化来源及潜在变异。

方法

提取样本核酸,非特异性反转录扩增病毒基因组RNA,使用Ion Torrent二代测序仪进行病毒全基因组测定。对获得的基因组数据进行序列拼接、比对、进化树构建和关键位点分析。

结果

通过测定获得了病毒全基因组11 979nt,该测定病毒属E基因分支,序列与先前南非分离株Kakamas相似度最高(>98%)。病毒Gn蛋白C端信号肽区存在1个氨基酸突变。

结论

本研究分析测定的裂谷热病毒全基因组与目前非洲流行株高度相似,病毒基因特征未出现明显变异。

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