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采用solexa测序技术，对大刍草苗期全株各组织转录组进行了RNA-Seq测序、de novo拼接和信息比对研究。结果表明：转录组测序共得到了46.4 GB的原始数据，归并整理后获得长76 bp的序列有175 101 250条，经质量控制和de novo拼接后，共获得了58 147条大刍草转录本，其平均长度为1 335 bp。比对分析发现其中94.3%的转录本和玉米B73自交系的cDNA序列有较好的匹配，与水稻匹配的有84.1%，高粱84.6%，短柄草83.9%，共56 036条转录本。