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浓缩Vero细胞乙脑疫苗经SepharoseCL-6B柱层析可去除大部分杂蛋白,再经SphacrylS-500HR层析可进一步去除比病毒大的杂质及残余小分子量杂蛋白。经两步凝胶过滤层析化后,疫苗总蛋白含量减少约99%,抗的比活怀提高87-165倍,抗原回收率达30-50%,残余牛血清和残余细胞DNA均符合WHO有关规程要求,提纯疫苗的效力达到或超过中国地鼠肾灭惭脑疫苗和日本提纯鼠脑疫苗的参考苗。