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《临床荟萃》经过多项学术指标（包括总被引频次、影响因子、即年指标、基金论文比、国际论文比、平均作者数、参考文献量、平均引文率等15项计量指标）综合评定及同行专家评议推荐，本刊2006年4月被收录为“中国科技论文统计源期刊”（中国科技核心期刊）。在此之前，《临床荟萃》已连续4届入选北京大学图书馆中文核心期刊要目总览“内科学类核心期刊”。