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短尾猴属灵长目（Primates）猴科（Cercopithecidae）猕猴属（Macaca），是我国特有的国家二级保护动物。为了更有效地保护其野生种群，本文研究了黄山短尾猴种群内的遗传多样性，并对黄山短尾猴与四川短尾猴种群间的遗传差异进行了分析。共测定了黄山短尾猴7个群体中的30个样本的mtDNA控制区5’端493bp的序列，只发现了7个变异位点，定义了3种单倍型，单倍型序列之间缺乏变异，种群中的核苷酸多样性很低（0．006）；3种单倍型相应地将黄山种群分为了3个亚群，不同亚群之间呈现出一定的片断化分布