【摘 要】
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以拟南芥WRKY蛋白序列及保守结构域种子文件(PF03106)检索香石竹(Dianthus caryophyllus L.)基因组数据库,共鉴定出香石竹WRKY家族基因Dca WRKY 53个,分别编码161～747个氨基酸,蛋白质平均分子量在18.27 ～ 82.58kD之间,等电点在5.07 ～ 10.25之间,内含子数1～5.系统发育分析显示,DcaWRKY可分为3组,其中group Ⅱ又可进一步分为5个亚组.DcaWRKY结构域具有高度保守性,皆为WRKYGQK七肽结构域,偶有变型.DcaWRKY
【机 构】
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华中农业大学园艺林学学院,园艺植物生物学教育部重点实验室,农业农村部华中都市农业重点实验室(试运行),武汉430070
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以拟南芥WRKY蛋白序列及保守结构域种子文件(PF03106)检索香石竹(Dianthus caryophyllus L.)基因组数据库,共鉴定出香石竹WRKY家族基因Dca WRKY 53个,分别编码161～747个氨基酸,蛋白质平均分子量在18.27 ～ 82.58kD之间,等电点在5.07 ～ 10.25之间,内含子数1～5.系统发育分析显示,DcaWRKY可分为3组,其中group Ⅱ又可进一步分为5个亚组.DcaWRKY结构域具有高度保守性,皆为WRKYGQK七肽结构域,偶有变型.DcaWRKY20的N端WRKYGQK七肽结构域出现缺失,形成了WRK的缺失变型;DcaWRKY39的C端WRKYGQK七肽结构域中的K突变成了N,形成了WRNYGQK七肽结构域;DcaWRKY48为WRKYGKK七肽结构域.DcaWRKY蛋白序列中至少存在10个保守基序,同源关系较近的成员具有相似的保守基序.启动子区的顺式作用元件分析显示DcaWRKY启动子区含有大量与光信号、植物激素、胁迫和分生组织等相关的功能域.转录组数据分析结果显示,有20个DcaWRKY在不定根形成过程中表现出不同程度地上调或下调,推测其可能在香石竹插穗不定根形成过程中发挥重要作用.定量分析结果表明DcaWRKY11、DcaWRKY13、DcaWRKY15、DcaWRKY22、DcaWRKY23、DcaWRKY31及DcaWRKY39的表达模式与转录组结果基本一致,且在香石竹不定根生长过程中表现出多样性.此外,DcaWRKY在生长素处理组和对照组中的表达水平无显著差异性,说明DcaWRKY对生长素不敏感.
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