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目的探讨如何完善保健食品申报代理机构的管理机制,促进保健食品市场有序健康发展。方法对北京市2006~2013年保健食品注册中代理机构申报情况进行统计,并分析保健食品申报代理机构的优势及存在的问题。结果与结论需通过完善法律法规;尽快实行保健食品分类管理;建立注册专员资格证书管理制度;加强对代理机构的信用监管,建立代理机构信用记录制;发挥代理机构的资源优势,服务于政府等措施,来引导保健食品申报代理机构健康发展。