葡萄苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析

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苯丙氨酸解氨酶(PAL)作为苯丙烷途径的入口酶,与植物生长发育以及生物和非生物胁迫响应等生物过程密切相关。本研究通过生物信息学方法,在已测序的葡萄基因组中预测得到17个PAL基因,其中13个串联分布在第11和16号染色体的2个重复基因群中,4个随机分布于其他染色体。系统发育树分析表明,葡萄大部分PAL基因与双子叶植物PAL基因聚为一类,而串联分布于第11号染色体的4个PAL基因与单、双子叶植物PAL基因亲缘关系较远。利用‘赤霞珠’葡萄果实转录组数据克隆获得5个PAL基因的全长编码序列,序列分析显示,这些PAL基因能够编码具有完整结构域的PAL蛋白。表达谱分析及产物检测结果表明,VviPAL2和VviPAL15在葡萄果实和其他组织中的表达量相对较高,且在不同发育期果实中的表达与酚类物质的积累密切相关。此外,果实曝光和遮光处理分别促进和抑制VviPAL2、VviPAL4和VviPAL7的表达及相应产物的积累。
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