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利用微观经济学的基本工具分析了植物品种权的资源配置效率，指出植物品种权保护制度是通过赋予品种权人市场垄断力量的方式对其育种创新的投入进行补偿，但垄断又必然导致社会成本的增加，因而决定了植物品种权保护制度不是最优的资源配置方式。但是，根据不同情况而构建不同的最优品种权组合来平衡社会受益与私人收益，可以提高植物品种权保护制度的运行效率，这一点对于植物品种权保护制度的设计具有重要的意义。