广东湛江杂草稻qSH1基因片段序列分析

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为了探明杂草稻与栽培稻qSH1基因片段的序列是否存在差异,为研究杂草稻的落粒性提供依据。利用已经报道的扩增水稻qSH1基因的引物,对来源于广东湛江雷州地区的6份落粒性极强的杂草稻进行PCR检测,通过测序得到长度约460bp的核苷酸碱基序列,将获得的序列进行比对分析,序列分析结果表明:扩增所获片段大致位于qSH1基因下游100kb处,其碱基序列与NCBI网站公布的水稻该片段序列为同源序列,同源性达100%。这6份杂草稻与水稻之间共同存在一个碱基位点差异,经证实为前人报道的SNP位点。另外6份杂草稻所获片段序
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