为比较水环境质量评价方法的适用性和局限性,在分析几种常用评价方法的基础上,利用2008年长江流域和淮河流域190个国控断面水质监测数据对单因子评价法、平均污染指数法、内梅罗指数法、灰色关联分析、模糊综合评价、物元可拓评价法、综合水质标识指数法等7种方法进行实证研究。结果表明:①指标权重的选择对评价结果影响有限,73.7%的断面评价等级没有因权重发生变化,但物元可拓法对权重变化较为敏感。②当评价指标污染程度相当时,平均污染指数法较为适合;当某指标污染程度较为突出时,内梅罗指数更为恰当。但两者评价结果吻合程度较高,相关系数达0.94,且水质越差,结果越接近。③分级评分法和单因子评价法评价结果差异较大,仅有10%左右的断面评价等级一致,且水质越差,各种方法所得的评价等级差别越大。④各种评价方法具有一定的关联性和互补性,评价等级相关系数在0.7左右。综合各种评价方法理论上的优缺点并结合环境管理需求,单因子评价法和综合水质标识指数法是两种优选方法,在水环境质量评价中可以组合使用。