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DNA条形码是指利用一段相对较短的标准DNA片段，对物种进行识别和鉴定。目前该技术在动物、植物物种鉴定领域已经得到了广泛的研究和应用。在藻类的研究中，尚未确定一条统一的标准条形码基因，现阶段都是使用2条或2条以上基因序列来完成物种鉴定。对于形态多样、种类繁多的海洋红藻，常用的DNA条形码基因有COI基因（Partial cytochrome c oxidase I gene）、UPA基因（Partial 23S rRNA gene, universal plastid amplicon）、LSU基因（（P