利用Agilent定制基因芯片筛选相同病理类型、不同预后的早期乳腺癌的分子标记物

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目的分析相同病理类型、临床分期(Ⅰ~Ⅱ期)但预后不同的乳腺癌组织的基因表达差异,筛选出有意义的基因组合,寻找与乳腺癌预后相关的基因,探索可以早期预测乳腺癌预后的基因分型诊断标准。方法用Agilent定制人8×15 000芯片对筛选出的实验组8例早期乳腺癌患者的组织标本,结合其预后数据,进行差异基因表达分析;采用Real-time PCR技术,在同期收集的验证组42例乳腺癌样本中对差异表达的基因进行验证。结果基因芯片检测分析发现,实验组预后差样本比预后好样本有差异表达基因132个,其中44条基因显著上调,88条基因显著下调(差异均在2倍以上)。结论相同病理类型、临床分期、不同预后的早期乳腺癌组织中基因表达存在显著差异,CD44、MKI67、NTRK2、Nek2、C16orf60、TOP2A、ANCCA、RRM2等8个基因可以作为早期乳腺癌预后预测基因标记物。
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