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江汉平原湖区是长江流域生态环境最脆弱的地区之一，洪涝灾害严重、泥沙淤积和沼泽化现象普遍、湖泊水体污染与富营养化问题突出、血吸虫未得到根治等是该区目前存在的主要生态环境问题。这些问题的出现与流域地区的自然地理环境和条件及人为影响密切相关。治理长江中游江汉平原湖区生态环境问题的对策主要包括：树立综合治理的思想，强调统一规划管理，突出治水中心环节；工程措施与生物措施相结合，标本兼治；控制人口增长，合理利用湖区资源；控制湖泊水体污染、治理湖泊富营养化现象；构建完善的湖区可持续发展保障机制。