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短管兔儿草为典型的高山植物，具较强的光合能力，但光合效率较低。叶片具有发达的通气贮气组织；栅栏组织发达，叶绿体基粒片层较少。短管兔儿草光合作用特性易受生长环境因素的影响。低温胁迫使短管兔儿草光合速率、光合量子产额降低。低温下的光照加剧了光合作用受抑制的程度。本研究表明，短管兔儿草具较强的抗冻能力，是研究植物抗冻机理及筛选抗冻基因的理想材料。