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扩增片段长度多态性（amplified fragment length polymorphism，AFLP）是一种用来检测基因组多态性的新一代分子标记，具有分辨率高、稳定性好、重复性好等特点。近年来，AFLP已广泛用于动物、植物、微生物等许多研究领域，在遗传图谱的构建、遗传多态性的分析、系统分类学等方面显示了极大的优越性。本文主要介绍其原理、方法特点以及在微生物学上的应用。