【摘 要】
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植物通过启动一系列信号转导途径来应对外部环境,这些途径通常涉及多种蛋白激酶,CBL特异性结合蛋白(CBL-interacting protein kinases,CIPKs)是其中的重要成员之一。本研究利用序列比对法在蓖麻(Ricinus communis)全基因组范围内进行CIPK基因家族鉴定;利用生物信息学手段对基因家族成员序列结构、理化性质、染色体定位、启动子顺式作用元件、蛋白保守结构域、系统进化关系以及聚类方式进行分析;利用RNA-seq与qRT-PCR对RcCIPKs在冷胁迫下的表达进行分析;利
【机 构】
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内蒙古民族大学生命科学与食品学院,内蒙古民族大学生命科学与食品学院资源生物与生态研究所,内蒙古民族大学科尔沁植物逆境生物学研究所,内蒙古民族大学农学院,天津农学院
【基金项目】
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国家自然科学基金(32060493,31760399,61971312),自治区高校“青年科技英才支持计划”(NJYT-20-B25),自治区留学人员创新创业启动支持计划,国家服务特殊需求蒙药学博士点建设专项开放基金项目(MDMYBJ2019008)。
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植物通过启动一系列信号转导途径来应对外部环境,这些途径通常涉及多种蛋白激酶,CBL特异性结合蛋白(CBL-interacting protein kinases,CIPKs)是其中的重要成员之一。本研究利用序列比对法在蓖麻(Ricinus communis)全基因组范围内进行CIPK基因家族鉴定;利用生物信息学手段对基因家族成员序列结构、理化性质、染色体定位、启动子顺式作用元件、蛋白保守结构域、系统进化关系以及聚类方式进行分析;利用RNA-seq与qRT-PCR对RcCIPKs在冷胁迫下的表达进行分析;利
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