蒙古冰草(Agropyron mongolicum)落粒相关基因Amsh1克隆及进化分析

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蒙古冰草因籽粒脱落导致的种子减产现象非常严重.为了揭示蒙古冰草的落粒机制,本研究主要通过同源克隆的方法,扩增得到蒙古冰草落粒相关基因的cDNA全长序列,分别命名为Amsh1-1和Amsh1-2.对克隆到的基因进行生物信息学分析.结果表明,Amsh1-1基因cDNA全长935 bp,开放阅读框561 bp,共编码氨基酸186个,蛋白质相关分子量为20 990.03,具有典型的YABBY结构域,是一个不稳定蛋白.Amsh1-2基因cDNA全长1 118bp,开放阅读框624bp,共编码氨基酸207个,蛋白质相关分子量为22 759.70,具有典型的YABBY结构域,是一个不稳定蛋白.系统进化树分析显示,Amsh1-1与大麦的Hvsh1同源性最高,Amsh1-2与毛竹的Pesh1同源性最高.本研究为进一步的探究落粒基因的作用机制提供理论依据.
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