利用16S rRNA测序、PCR-DGGE和qRT-PCR方法分析肉牛瘤胃上皮细菌群落特征

来源 :中国畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zbz963

【摘要】

：

目前对于附着于瘤胃上皮的细菌群落及其功能了解较少,本研究目的是利用16SrRNA测序、PCR-DGGE和qRT-PCR方法比较分析肉牛瘤胃上皮与瘤胃内容物细菌群落的多样性差异。从6个16

【作者】

：

Li M 赵圣国

【出处】

：

中国畜牧兽医

【发表日期】

：

2013年1期

【关键词】

：

瘤胃细菌多样性变形梯度凝胶电泳 16S rRNA序列分析菌群比较

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目前对于附着于瘤胃上皮的细菌群落及其功能了解较少,本研究目的是利用16SrRNA测序、PCR-DGGE和qRT-PCR方法比较分析肉牛瘤胃上皮与瘤胃内容物细菌群落的多样性差异。从6个16SrDNA（～1.4kb）文库中随机选取2785条序列,结果表明3个瘤胃内容物文库与3个瘤胃上皮文库的细菌群落存在差异。以97%的序列相似度进行计算,结果发现瘤胃内容物菌群文库的多样性指数（4.12/4.42/4.88）比瘤胃上皮组织菌群文库的多样性指数（2.90/2.73/3.23）高。厚壁菌门和拟杆菌门分别是瘤胃上皮组

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