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2006年9月，南隍城岛附近海域首次发生由塔玛亚历山大藻（Alezandrium tamarense）引发的大规模赤潮，面积约2．37km^2，最大细胞丰度2．334×10^8cell／L，大量衰亡赤潮生物的分解消耗水体的溶解氧，引起中下层水体严重缺氧，导致当地网箱养殖的鱼类全部死亡，藻体分泌的麻痹性贝毒（PSP），导致岸边的皱纹盘鲍近一半死亡。通过对这次赤潮的研究认为：其成因主要是由船舶压舱水排海带来赤潮生物物种，大量陆源有机物、营养盐类的排入和大规模贝类筏式养殖的自身污染为赤潮生物的暴发性繁