【摘 要】
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目的 基于生物信息学分析弓形虫穿孔素样蛋白2(TgPLP2)的结构及性质、翻译后的修饰以及抗原指数.方法 利用 ProtParam、SignalP5.0、TMHMM、MegAlign、MAFFT、SMART、SOPMA、Swiss model、NetPhos、SYFPEITHI 及IEDB等软件分别预测TgPLP2的理化性质、信号肽、跨膜区、蛋白质的结构、翻译后修饰情况、B细胞和T细胞抗原表位.结果 TgPLP2是一种亲水性蛋白,相对分子质量为92 185.19,含有79个潜在的翻译后修饰位点,无任何跨膜
【机 构】
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新乡医学院基础医学院病原生物学系,河南新乡453003;新乡医学院新乡市病原生物学重点实验室,河南新乡453003;新乡医学院基础医学院病原生物学系,河南新乡453003;新乡医学院基础医学院病原生物
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目的 基于生物信息学分析弓形虫穿孔素样蛋白2(TgPLP2)的结构及性质、翻译后的修饰以及抗原指数.方法 利用 ProtParam、SignalP5.0、TMHMM、MegAlign、MAFFT、SMART、SOPMA、Swiss model、NetPhos、SYFPEITHI 及IEDB等软件分别预测TgPLP2的理化性质、信号肽、跨膜区、蛋白质的结构、翻译后修饰情况、B细胞和T细胞抗原表位.结果 TgPLP2是一种亲水性蛋白,相对分子质量为92 185.19,含有79个潜在的翻译后修饰位点,无任何跨膜结构域.二级结构以无规卷曲和α螺旋为主.此外,还检测到了几种可能的B细胞和T细胞表位.蛋白的抗原性分析表明其具有抗原性.结论 TgPLP2可能是一种具有良好免疫原性的蛋白,理论上可诱导强大的免疫反应,且具有多个潜在的B细胞和T细胞表位,综合分析提示TgPLP2是一种合适的弓形虫疫苗候选分子.
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