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高度创新性的治疗方法为疾病治疗带来突破希望的同时，也导致了意想不到的严重不良反应。比如说，干细胞重复移植会导致多种供体细胞瘤，逆转录病毒载体转基因技术可能会导致T细胞白血病。因其生物机制还未完全研究清楚，诸如此类的治疗方法都被视为高度创新性的治疗手段。目前动物模型还不能准确地预测其在人体中的反应，而且不良反应也不能通过降低初始治疗剂量得以减少。此外，这些高度创新性的治疗方法在临床中应用的经验几乎很少或没有。