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和谐社会内在地蕴涵着法治精神，利益的冲突需要正当、和平的诉求渠道与公正、有效的平衡机制；社会的发展、利益主体的多元化，传统诉讼理念以私益救济为核心的制度安排逐渐受到挑战。科技活动兼备公共效益性和公共侵害性特征，易产生公、私利益的冲突，公益诉讼是解决公、私利益矛盾的重要途径，可以作为科技管理的长效机制。在和谐社会的思想内蕴与精神旨趣统筹下，以法经济学分析为视角，考量公益诉讼的机理并以社会效益优化为逻辑起点，构建一套公益诉讼的制度服务于科技管理活动的需要。