HIV-1整合酶抑制剂的虚拟筛选方法的建立

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从PDB(Protein Data Bank)网站下载HIV-1整合酶的晶体结构,利用PyMOL软件删除多余的分子,通过对晶体结构进行分析,通过 PyMOL软件分析整合酶与D77结合的模型,确定活性氨基酸位点。利用AutoDockTools软件设定虚拟筛选的Gridbox。通过新的虚拟筛选工具PyRx运行AutoDock Vina,建立高通量的HIV-1整合酶抑制剂的虚拟筛选方法。
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