基于TCGA数据库分析HPRT1在口腔鳞状细胞癌中的表达及意义

来源 :天津医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:suxinlan2009
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探讨次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶1(HPRT1)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达及功能.方法:下载TCGA数据库中的OSCC转录样本(n=394),包括癌症组织(n=362)及正常组织(n=32),以及381例临床数据.分析HPRT1的表达与OSCC预后的关系.利用基因集富集分析探讨HPRT1在OSCC中可能的作用机制.探讨HPRT1与OSCC中免疫细胞的相关性.结果:HPRT1在OSCC组织中高表达(t=1.856,P<0.001),HPRT1高表达组的总生存率更差(P<0.05).HPRT1与肿瘤分级、病理分期及T分期呈正相关.Cox回归分析结果提示HPRT1是OSCC预后的独立因素(P=0.002).基因富集分析提示HPRT1可能与基础转录因子通路、细胞周期通路、DNA复制等通路(FDR<0.05,P<0.05)以及氨酰-tRNA生物合成通路、碱基切除修复通路(P<0.05)有关.HPRT1高表达与调节性T细胞、休眠肥大细胞、中性粒细胞和嗜酸性粒细胞的含量具有相关性(均P<0.05).结论:HPRT1在OSCC组织中高表达并与OSCC的进展有关,可作为OSCC预后评估的潜在标记物.
其他文献
目的:探讨儿童肺动脉窦(PSC)起源的室性心律失常(VAs)射频消融方法及安全性。方法:回顾性研究。选择2014年3月至2020年7月广东省人民医院心儿科成功行射频消融治疗的15例PSC起源的VAs患儿,患儿均符合射频消融手术适应证,总结其心电图特点及射频消融方法,射频消融术中根据患儿的年龄、体质量选择不同弯型的消融导管,将消融导管采用倒“U”型或倒“P”型的方法送至PSC,术后随访预后,评价其安全性。结果:患儿年龄6~15(11.6±2.6)岁,体质量19~65(39.9±12.2) kg,PSC起源V
目的:运用网络药理学方法筛选党参、海藻“药对”治疗肝癌主要化学成分,预测其作用靶点及通路.方法:借助中药系统药理分析数据库(TCMSP)、“中国知网”数据库检索党参、海藻“药对”的化学成分;TCMSP、PubChem、SEA以及Swiss Target Prediction数据库检索化学成分的靶点;通过TTD、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取肝癌的相关作用靶点;运用Cytoscape3.8.2软件构建“党参、海藻-活性成分-靶点-肝癌”网络图;运用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络
目的:探讨孕晚期血清松弛素水平与产后盆底功能障碍性疾病(pelvic floor dysfunction,PFD)和盆底超声参数的相关性。方法:采用病例对照研究,收集2017年2月至2018年7月期间在郑州大学第二附属医院产检的孕妇348例,按照产后是否出现PFD将产妇分为病例组(自然分娩68例,剖宫产44例)和对照组(自然分娩134例,剖宫产102例),收集同期健康未孕女性100例为健康未育组。检测产妇妊娠37~40周的血清松弛素水平和产后42 d的盆底超声参数——膀胱尿道后角(posterior ve
子宫内膜异位症是一种最常见的影响育龄女性健康的慢性疾病,至今其病因与发病机制仍不清楚,构建适宜的动物模型有利于推进相关基础研究。目前啮齿类动物是较为经济,易于饲养,且子宫内膜结构与人类相似的实验对象。本文旨在分析比较近四年来啮齿类动物子宫内膜自体移植模型、同种异体移植模型以及异种移植模型等的构建方法、影响造模成功率的因素及其优缺点,并介绍了荧光定位模型、疼痛模型、深部型子宫内膜异位症模型等进展,为研究者进行关于发病机制和治疗的体内研究时选择适宜的动物模型提供参考。“,”Endometriosis is o
胚胎染色体异常是导致妊娠失败的主要原因之一,行胚胎植入前遗传学检测(preimplantation genetic testing,PGT),选择整倍体胚胎移植,可显著提高胚胎种植率和持续妊娠率。但由于PGT技术对胚胎的侵入性和技术的复杂性,限制了其在临床的广泛应用,开发一种安全、快速、经济的胚胎基因组检测方法将是生殖领域的一大进步。近年来,随着游离基因组DNA在胚胎培养液和囊胚腔液中的发现,许多学者开始探讨胚胎游离DNA在PGT中的适用性,然而目前的研究结果缺乏一致性结论。本文总结了胚胎培养液和囊胚腔液
辅助生殖技术(assisted reproductive technology,ART)是治疗不孕症的有效方法,但其安全性值得关注。控制性促排卵作用于卵母细胞印记基因完成重编程的时期,胚胎的体外培养作用于印记基因去甲基化的敏感时期。卵胞质内单精子注射(intracytoplasmic sperm injection,ICSI)操作会影响基因组、印记基因广泛擦除、印记重建及维持。配子及胚胎冷冻可能会导致基因表达紊乱,印记基因疾病发生的风险增加。ART过程中的非生理性操作是否会影响胚胎的表观遗传调控程序并进一
目的:探讨邻苯二甲酸二丁酯(dibutyl phthalate,DBP)通过腺苷酸活化蛋白激酶/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(AMP activated protein kinase/mammalian rapamycin target protein,AMPK/mTOR)信号通路对大鼠睾丸间质细胞(Leydig)凋亡的影响。方法:生殖功能损伤大鼠模型按照体质量排序分组法分为模型(DBP)组17只、模型+AMPK抑制剂[DBP+化合物C(compound C,CC)]组17只、模型+AMPK激动剂[DBP+二甲
目的:了解兰州市城区孕产妇叶酸知信行及相关卫生服务情况,为完善此项健康策略提供数据参考。方法:采用横断面研究方法,以年龄段分层随机选取2019年5月至2019年12月期间兰州市部分医疗机构孕检和住院分娩的孕产妇为研究对象,采用面对面问卷调查法获取叶酸知信行及接受相关卫生服务情况,通过多因素logistic回归分析其影响因素。结果:发放1060份问卷,共收回1060份,其中1046份有效问卷,有效率为98.70%。兰州市城区孕产妇的叶酸知识知晓率为79.06%(827/1046),其中问答叶酸可以预防胎儿神
多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)是一种累及5%~20%育龄妇女的生殖内分泌和代谢紊乱性疾病,是导致无排卵性不孕的主要原因。PCOS的临床表现具有明显的复杂性和异质性,其发病机制尚未明确。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是转录长度大于200个核苷酸的非编码RNA,能通过表观修饰、转录、转录后三个水平调控细胞生长、增殖、分化、凋亡等许多生物学过程。lncRNA是近年来PCOS领域的研究热点,研究显示 PCOS患者的外周血、卵
抗苗勒管激素(anti-Müllerian hormone,AMH)作为转化生长因子β超家族的成员之一,在女性体内随着年龄的变化而增减,并在两性分化中发挥重要作用。目前,AMH已成熟运用于辅助生殖领域,但在非辅助生殖领域的运用较少。本文就AMH在非辅助生殖领域的最新临床应用进展做简单综述,包括辅助诊断多囊卵巢综合征、预测女性绝经年龄、辅助诊断与治疗女性肿瘤、保存生育力、避孕及预测生育预后。“,”Anti-Müllerian hormone (AMH), as a member of the transfo