论文部分内容阅读
对HIV-1逆转录酶（RT）与二氟甲基苯并唑甲基嘧啶硫醚（DFMMT）及甲基苯并唑甲基嘧啶硫醚（MMT）两个甲基苯并唑衍生物的复合物进行了分子动力学模拟，从分子整体、结合模式优化和水分子作用3个角度详细分析了甲基苯并唑衍生物与HIV—lRT相互识别的机制。结果表明，DFMMT和MMT在RT中的结合位点几乎一致：但DFMMT与RT的叮T一叮T堆积作用更强。另外，RT的DFMMT结合口袋中有3个稳定的水分子存在．而MMT结合则没有水分子参与。3个水分子的协同使得DFMMT与RT的相互作用强于MMT．这可能是双