【摘 要】
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本文将前列腺癌(Prostate Cancer,PCa)PC-3M-1E8细胞为标靶的核酸适配体序列翻译成氨基酸序列,计算氨基酸序列的分子参数,然后用这些分子参数建立核酸适配体亲和性的构-效关
【机 构】
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湖南工程学院环境催化与废弃物再生化湖南省重点实验室,湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金(No.21190040,21190041),湖南教育厅重点项目(No.16A047),化学生物传感与计量学国家重点实验室(湖南大学)开放课题(No.2016013)
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本文将前列腺癌(Prostate Cancer,PCa)PC-3M-1E8细胞为标靶的核酸适配体序列翻译成氨基酸序列,计算氨基酸序列的分子参数,然后用这些分子参数建立核酸适配体亲和性的构-效关系模型。所用的候选核酸适配体序列是采用以细胞为靶标的指数富集配体系统进化(Cell-SELEX)技术筛选得到。模型训练集、测试集分别包含150、50条核酸序列,均由第3轮和11轮的候选核酸适配体组成。将第3轮的核酸序列类标签值设置为“1”,代表低亲和性、低特异性的候选核酸适配序列;将第11轮筛选所得核酸序列类标签值设
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