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花南沟钨钼矿是甘肃北山地区近年来发现的一个与花岗岩有关的大型斑岩型、石英脉钨钼矿床。花岗岩基本属于形成在低压条件下。产于地壳伸展减薄的构造背景下浅成的A型花岗岩，钨、钼矿化多与A型花岗岩有关。矿区北西、北东向断裂及次一级裂隙、石英脉发育地段发育有辉钼矿化，部分石英脉中含有白钨矿化，矿体在深部具富集趋势。