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针对药用植物丹参含有较多的多酚类、醌类等水溶性次生代谢物,在提取DNA时易发生共沉淀而很难除去等问题,设计双蒸水预洗不同次数和活性碳吸附杂质等处理,对CTAB和SDS两种DNA提取方法进行了系统优化。研究得出,采用2%的CTAB提取液和双蒸水预洗一遍并且添加样品鲜重4%的活性碳于提取液中的提取方法最佳。不仅能除去多酚类、醌类等次生代谢物,而且去多糖、蛋白质效果良好,所获DNA纯度高;RAPD-PCR实验结果稳定清晰可靠。