以2005年度基础科学和工业技术共8类中国科技核心期刊为研究对象,研究基金论文比与期刊影响力(影响因子与他引率的积)之间的相关关系。除力学类外,其余各类的二者间均存在不同水平的显著相关关系。从上述各类期刊中选取具有较高影响因子的一种期刊作为代表性期刊,发现其基金论文比与影响力并无显著的线性相关关系,说明在基金论文比达到一定水平时,刻意提高基金论文比并不一定能提高期刊影响力。以"计算机科学技术类"26种统计源期刊为对象分析2000年以来各刊基金论文比的变化趋势,得出多数期刊基金论文比不断增加,为最重要、最新的科研成果的更快、更好传播起到了积极的促进作用。以其中6种计算机工程与应用方面的期刊为对象分析科技期刊基金论文比与期刊影响力之间的关系,发现2000～2003年二者基本具有同样的变化趋势,但2003年以后二者相关度越来越小。因此得出结论:对基金论文比这个评价科技期刊学术水平和影响力的指标应有正确的认识,既要促进好的基金论文尽快发表,又要避免某些劣质论文借着基金论文的"外衣"影响其他高质量论文的发表。指出科技期刊评价体系应该根据科技期刊的发展规律及时地修改和调整,才能做到真实、公平和科学。